康熙三十六年(1697年)二月，康熙鑒于噶爾丹拒不投降，再次下詔親征。噶爾丹在眾叛親離的情況下，服毒自殺而死，至此康熙時期平定噶爾丹叛亂之戰(zhàn)始告結(jié)束，喀爾喀地區(qū)重新統(tǒng)一于清朝。

噶爾丹死后，策妄阿拉布坦便成為準(zhǔn)噶爾部的統(tǒng)治者。隨著他的統(tǒng)治地位的鞏固和地盤的不斷擴(kuò)大，又滋長了分裂割據(jù)的野心，沙皇俄國也積極支持其叛亂。策妄阿拉布坦在沙俄支持下，不斷襲擊清軍據(jù)守的科布多、巴里坤(今新疆巴里坤)、哈密等軍事重鎮(zhèn)，并派兵侵入西藏，進(jìn)行分裂叛亂活動。由于康熙及時派兵進(jìn)藏協(xié)同藏軍進(jìn)行圍剿，才將策妄阿拉布坦叛亂勢力趕出西藏。康熙帝逝世后，雍正繼續(xù)堅持平定準(zhǔn)噶爾貴族割據(jù)勢力的斗爭。

政治影響

在清朝，“大一統(tǒng)”、“一體”、“一統(tǒng)”和統(tǒng)一是同義詞，全國的統(tǒng)一對于清王朝來說，是不可動搖的目標(biāo)。正如康熙帝所說：“朕為天下一統(tǒng)主，務(wù)使四海之內(nèi)，人民咸獲其所，一享太平”。

康熙三征噶爾丹以后，清政府重新控制了阿爾泰山以東的漠北蒙古，給當(dāng)?shù)孛晒刨F族各種封號和官職。清政府又在烏里雅蘇臺設(shè)立將軍，統(tǒng)轄漠北蒙古。康熙五十六年(1717年)，噶爾丹的侄子策妄阿拉布坦攻占西藏，康熙派胤禵領(lǐng)兵入藏驅(qū)逐了準(zhǔn)噶爾勢力，維護(hù)了西藏地區(qū)的安寧。

軍事影響

清軍平定準(zhǔn)噶爾貴族分裂叛亂戰(zhàn)爭的勝利，不僅維護(hù)、鞏固了西北邊陲，消滅了準(zhǔn)噶爾貴族分裂勢力，而且也打擊了沙皇俄國侵略中國準(zhǔn)噶爾的野心。之后的康熙五十九年(1720年)，康熙帝派兵遠(yuǎn)征西藏，驅(qū)逐了策妄阿那布坦，護(hù)送達(dá)賴?yán)锪肋M(jìn)藏。以后，清政府又在拉薩設(shè)置駐藏大臣，代表中央政府同達(dá)賴、班禪共同管理西藏。

地緣影響

清朝統(tǒng)治者對于割據(jù)一隅的邊疆民族政權(quán)并未簡單地斥之為分裂或分裂政權(quán)。而是在不同的階段、對不同的民族、按不同的地區(qū)所確立的不同關(guān)系采用了不同的稱呼，實施不同的政策。在與邊疆民族各部的關(guān)系上，清朝統(tǒng)治者明確規(guī)定：“分疆別界，各有定制”。

從清初至18世紀(jì)統(tǒng)一多民族國家最后形成的一百年間，中國廣闊的土地上，既有清王朝，也有邊疆民族政權(quán)，多種政權(quán)和多種制度并存，相互之間既有吸收、融合又有排斥和對抗，除了準(zhǔn)噶爾與清朝對抗時間較長外，其他基本都處于和平交往的狀態(tài)中，這種長時間的多種政權(quán)并存的局面為各民族和各民族政權(quán)的經(jīng)濟(jì)文化發(fā)展創(chuàng)造了有利時機(jī)，也為統(tǒng)一多民族國家形成和版圖奠定的穩(wěn)定性提供了時間的保證。