《明史紀事本末》記載，永樂十八年，朱棣下了一條奇怪的命令：凡北京、山東境內尼及道姑，逮上京詰之。隨后，明朝政府開始大肆抓捕尼姑道士，全國所有的尼姑以及女道士，統統被逮捕送到京師逐一審問，驗明身份。明成祖與這些講究六根清凈、四大皆空、與朝廷素無瓜葛的尼姑有何恩怨，以致全國的尼姑都遭受這前所未有的侵擾和追捕？

這場千古以來史無前例的尼姑逮捕案，起源于一場農民起義運動。永樂十八年，山東境內發生了嚴重的災荒，官府不但沒有發救濟糧，還抓捕了大量聚眾向官府討要糧食的農民，許多人被活活打死。二月唐賽兒以白蓮教的名義組織農民數千人，以紅白旗為號于濱州起義對抗朝廷。起義軍迅速占領了青州、諸城、呂縣、軍威大振，山東地方官吏惶恐不安，三司聯名報警。

明成祖朱棣聞報后大為震動，立即派遣官員，星夜趕往卸石棚寨招安;但遭到唐賽兒的堅決拒絕。明王朝雖然鎮壓了這次農民起義，但主要起義領袖唐賽兒、賓鴻、董彥皋等都安全轉移。朱棣大為震怒，將柳升下獄，并以“縱賊為亂不言”的罪名，把山東布政使、參議、按察使、按察副使、僉事和出現起義的郡縣官吏，統統處死。

為追查唐賽兒下落，又于同年3月至5月，兩次下令逮捕京師、山東境內的女尼和女道士，后又逮捕全國數萬名女尼和女道士，押解京師審查，但終未發現其蹤跡。因為她利用白蓮教在社會上的廣泛影響，組織群眾。自號“佛母”，聲稱能預知未來。為了防止唐賽兒出家為尼，混入道姑行列，永樂皇帝在同年三月和五月下令：“凡北京和山東境內尼及道士悉捕至京師詰問之?！薄胺曹娒駤D女出家為尼及道者，悉關京師。”于是先后有一萬多名尼姑、道姑被逮往京師詰問，但是唐賽兒還是“不知所終”。

唐賽兒的下落有兩種說法：唐賽兒兵敗后官軍搜埔她不能得，懷疑她隱藏在尼姑或女道士中，于是逮捕了北京、山東等地尼姑女道士多人，送京都審問，但終未能抓唐賽兒。

唐賽兒曾被生擒，九朝野記所載：“既而捕得之，將伏法，恬然不懼。裸而縛之，詣市臨刑。刃不能入。不得己，復下獄，三木被體，鐵鈕系足，俄皆自解脫，竟遁去，不知所終。”

至于唐賽兒是否藏于佛門，或是戰死沙場，或是為人民群眾保護，后人不得而知。但是直到朱棣去世，官府依然沒有她的下落。幾百年間，歷代史學家為了尋她，皓首窮經，至今仍無定論。