乾隆南巡聲勢(shì)浩大，花費(fèi)頗多，不可能所有銀兩都由國庫支出。乾隆南巡的主要財(cái)政支柱是兩淮的鹽商，兩淮鹽運(yùn)使司公署就設(shè)在揚(yáng)州城內(nèi)，八大商總也住在揚(yáng)州城內(nèi)。

乾隆十四年十一月，兩淮鹽政吉慶上奏《奏為圣駕南巡兩淮商人程可正等公捐百萬銀兩事》，奏折中提到“江省幸蒙恩允南巡，萬姓歡騰，淮商倍切所需費(fèi)用久愿公捐，其踴躍難形情狀”，由此就可見當(dāng)時(shí)為迎接乾隆首次南巡，鹽商積極踴躍、拋金撒銀的巨大手筆。

賈麗琴說，乾隆南巡，揚(yáng)州是“駐蹕之地”，為迎接圣駕，必然要對(duì)道路、橋梁、碼頭、行宮名勝甚至是附近上山道路進(jìn)行修整?！肚鍖m揚(yáng)州御檔》中，江蘇巡撫雅爾哈善就有一道題為《奏為江都縣瓜洲渡江馬船大修所需工料請(qǐng)動(dòng)支給辦事》的奏折。南巡路線中，乾隆從揚(yáng)州游覽結(jié)束后，必然要從瓜洲過江至鎮(zhèn)江。而瓜洲渡江大馬船自乾隆九年小修，至此已經(jīng)過了5年，船身已經(jīng)腐朽，雅爾哈善這道奏折正是請(qǐng)旨希望從司庫存公銀內(nèi)支取大修所需工料造價(jià)。

對(duì)于南巡事宜的開支報(bào)銷，乾隆做出了動(dòng)用官項(xiàng)和淮商捐資分別報(bào)銷的諭旨。根據(jù)乾隆的指示，兩江總督黃廷桂、兩淮鹽政吉慶也擬定了相關(guān)規(guī)定，要求?？顚Ｓ?，如道路、橋梁、碼頭、營尖、茶棚等類動(dòng)用藩庫銀兩，行宮、名勝及附近上山道路、鋪墊、陳設(shè)等類動(dòng)支兩淮鹽運(yùn)銀庫的商捐銀兩，各項(xiàng)支出分別登記造冊(cè)。

乾隆南巡涉及地方較多，對(duì)于各地及官項(xiàng)、商捐項(xiàng)花費(fèi)的平衡，考慮到地方官員需要辦理的事項(xiàng)較多，又從商捐項(xiàng)下?lián)茔y十五萬兩，交與藩庫幫助地方官員辦理事務(wù)。具體為，撥銀五萬兩給江寧藩庫，十萬兩給蘇州藩庫，由他們根據(jù)各自實(shí)際情況酌情動(dòng)用。專門撥給河庫兩萬兩，辦理相關(guān)事務(wù)。